论文开题报告：环肽cyclo[D-Ala-L-Ala]n=5~8纳米管中H2O的迁移和扩散

大学本科毕业论文(设计)开题报告
学院：化工学院　　　　　　　　　　　　专业班级：制药工程

课题名称 环肽cyclo[D-Ala-L-Ala]n=5~8纳米管中H2O的迁移和扩散

1、本课题的的研究目的和意义：
由于环肽纳米管特别易于聚集的特点，使其溶解度很低，这在实验上对其结构、性质的研究存在很大的困难。目前对环肽纳米管的结构性质、自组装效应和传输机理的研究还处于初级阶段，因此本论文的研究目的在于利用分子模拟技术，研究纳米管中水分子迁移量与迁移速度的关系，并分析结合能、氢键对迁移速度的影响。通过研究水分子在纳米管中的迁移速度及对迁移速度大小的影响因素分析，对下阶段的有关纳米管在药物载体和生物通道等方面的研究具有重要的指导意义和提供依据。

2、文献综述（国内外研究情况及其发展）：
分子尺度的中空管状结构在化学、生物化学和材料科学中有广泛的应用。大孔径的纳米管可以运输分子通过油质双层膜，把药物运输到活体细胞中，在抗过敏和基因治疗等方面也有许多潜在的用途。化学合成的纳米管通常是由合适的结构单元通
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验分子轨道AMl方法(semi-empirical mol- ecular orbital AMl method)和密度泛函B3LYP方法进行了系统的考察，研究了它们的几何构型以及自组装的动力(Driving force)和取代基、环大小对自组装过程的影响。

3、 本课题的主要研究内容（提纲）和成果形式：
主要研究内容：
① 不同量水分子环十肽纳米管中迁移的动力学计算；
② 不同量水分子环十二肽纳米管中迁移的动力学计算；
③ 不同量水分子环十四肽纳米管中迁移的动力学计算；
④ 不同量水分子环十六肽纳米管中迁移的动力学计算；
成果形式： 获得环肽纳米管中水分子的迁移速度

4、 拟解决的关键问题：
确定H2O分子的迁移量与环肽cyclo[D-Ala-L-Ala]n=5~8纳米管管径的关系
5、研究思路、方法和步骤：
研究思路：查阅文献，拟定实验方案--→搭建不同n值的环肽纳米管模型--→对其进行几何优化和构象分析--→进行动力学运算及分析得到不同量水分子在环十、十二、十四和十六肽纳米管中迁移的原始数据--→分析获得环肽纳米管半径、水分子与纳米管结合能以及水分子间氢键对水分子迁移速度的影响关系。
方法：利用Materials Studio软件平台搭建环肽纳米管传输通道模型, 运用分子力学和分子动力学的模拟方法进行计算。
步骤：1）环肽纳米管传输通道的构建。
2）计算得到的不同量水分子在环五、六、七和八肽纳米管中迁移的原始数据存放在动力学轨迹文件中。
3）对轨迹文件进行分析比较。

6、本课题的进度安排：
2012.1.10-2.10：与指导老师联系初步了解课题内容。
2012.2.12-3.10：查阅相关文献确定思路及方法，熟悉操作软件。
2012.3.11-5.10：开始实验，数据处理。
2012.5.11-5.30：整理实验结果撰写论文并修改。
2012．06：毕业论文答辩。
7、参考文献：
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[2] Trabi M, Craik D J. Trends in Biochemical Sciences[J]. 2002, (27): 132-138.
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[5] 陈心, 罗素兰, 张本等. 多肽固相合成的研究进展[J]. 生物技术, 2006, (01).
[6] 韩香, 顾军. 固相法在多肽合成领域的应用[J]. 药学进展, 2004, 28(1).
[7] Carter O, Moore C, Mynderse R. E. J, et al. J. Org. Chem [J], 1984, 49: 236-241.
[8] 刘北一, 朱平, 姜世勃, 等. 合成环肽抑制HIV-1病毒介导的细胞融合的初步研究[J]. 热带医学杂志, 2006, (08).
[9] 季崇敏, 吴伟, 徐惠南. 自组装环肽纳米管在药学领域中应用的研究进展[J]. 中国临床药学杂志, 2004, 13(05): 324.
[10] 唐敏, 樊建芬, 刘健, 等. 环肽纳米管的应用研究 ……（未完，全文共4098字，当前仅显示2070字，请阅读下面提示信息。收藏《论文开题报告：环肽cyclo[D-Ala-L-Ala]n=5~8纳米管中H2O的迁移和扩散》）