抗癌伴孢晶体蛋白的结构生物学（开题报告）

大学本科毕业论文(设计)开题报告
学院：化工学院 　　　　　　　　　　　　　专业班级：生物工程一班

课题名称 抗癌伴孢晶体蛋白的结构生物学

1、本课题的的研究目的和意义：

目的：本研究在已有的研究基础上，利用蛋白结构预测手段，对突变蛋白质P11、P32的以及未突变蛋白P2Y的空间结构进行预测，以推测P11、P32、P2Y的3D空间结构，再进行P11、P32与P2Y二级结构和三级结构间的比较，找出异同点，为今后进一步确定其抗癌构效关系的研究奠定基础。

意义：苏云金芽孢杆菌（Bacillus thuringiensis，简称Bt）是一种分布及其广泛的革兰氏阳性细菌，其在芽胞形成的过程中伴有蛋白晶体的形成，称为伴
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2Y二级结构和三级结构间的比较，找出异同点，为今后进一步确定其抗癌构效关系的研究奠定基础。

成果形式：成果以论文的形式体现



4、 拟解决的关键问题：

对突变蛋白质P11、P32的以及未突变蛋白P2Y的空间结构进行预测，以推测P11、P32、P2Y的3D空间结构，再进行P11、P32与P2Y二级结构和三级结构间的比较，找出异同点，进行分析。




5、研究思路、方法和步骤：

运用软件Discovery Studio Client对目标蛋白进行同源建模，具体步骤如下：
（1）搜索与目的的蛋白相匹配的模型---同源蛋白，
（2）将目的蛋白与同源蛋白进行多重序列比对，
（3）使用 MODELER产生目的序列的模型，
（4）模型的评估，
（5）数据分析。
6、本课题的进度安排：

2011年10月-11月：文献查找及熟悉同源建模软件
2011年11月-2011年12月：运用软件Discovery Studio Client对目标蛋白进行同源建模
2011年12月-2012年1月：分析数据，写论文
2012年5月-6月：论文的后期处理以及PPT的制作



7、参考文献：

1、Crystal Structure of the Parasporin-2 Bacillus thuringiensis To*in That Recognizes Cancer Cells,J. Mol. Biol. (2009) 386, 121–133
2、Homology model of RSK2 N-terminal kinase domain, structure-based identification of novel RSK2 inhibitors, and preliminary common pharmacophore,Bioorganic & Medicinal Chemistry 14 (2006) 6097–6105
3、蛋白质结构预测实验指南,岳俊杰，冯华，梁龙主编
4、
5、短小芽孢杆菌木聚糖酶的同源建模及分子动力学模拟,葛慧华, 李红春, 张光亚,Journal of Huaqiao University (Natural Science),Vol.32 No.3 May.2011
6、大麻素受体CB1三维结构的同源模建及其对接研究,涂国刚 ,李少华,化学学报,Vol.69,2011 No. 8,1007～1010
7、抗癌晶体蛋白 Paras pori n2 2空间结构的研究, ……（未完，全文共2273字，当前仅显示1444字，请阅读下面提示信息。收藏《抗癌伴孢晶体蛋白的结构生物学（开题报告）》）