大学本科毕业论文(设计)开题报告
学院:化工学院 专业班级: 生物工程专业
课题名称 产蛋白酶菌株VV6及*H7的分类鉴定
1、本课题的的研究目的和意义:
细菌分类学是研究细菌分类理论和方法的科学,它包括(分类、命名、和鉴定)3个独立和相关的分类学领域。细菌鉴定的应用:动、植物检疫、食品卫生检验、人类及动、植物病原诊断、环境微生物学研究。主要任务是在全面了解细菌的生物学特征的基础上,研究它们的种类,探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系,进而提出能反映自然发展的分类系统,并将微生物加以分门别类。所谓分类,就是在对大量细菌进行逐一的观察、分析和描述的基础上,按照它们个体发育的形态、培养特征、生理生化特征、细胞化学组分以及分子生物学特征等一系列性状的异同和主次,并根据它们的亲缘关系和应用的方便,加以分门别类(归纳为纲、目、科、属、种),从而制定为鉴定用的检索表,用
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和微机系统,广泛的鉴定功能,适用于临床微生物实验室。卫生防疫和商标标系统,主要功能包括细菌鉴定、细菌药物敏感性试验及最低抑菌浓度(MIC)的测定等。其准确性和可靠性均已大大提高。
1675年,荷兰商人Leeuwenhock自制了第一架显微镜
1753年瑞典博物学家林奈(Carolus Linnaeus)在《植物种志》一书中提出二界系统[2]。
1838年,德国生物学家Ehnenberg把细菌列为纤毛虫纲,分为2个科,即单胞菌科和弧菌科,弧菌科再划分5个属。1857年德国植物学家Negeli将其独立设一纲,取名为裂殖纲。
1872年,德国植物学家Cohn发表了一个新的细菌分类系统,根据形态特征把细菌分成4个族,每个族由1至多个属组成。
1854年,Koch发明了固体培养基,从而有可能获得纯培养物来进行研究。
1909年,Jensen发表了一种分类法,采用形态和病原性特征,还依据细菌代谢活性,突破了纯形态的分类局限,在细菌分类学上向前迈出了重要一步。
1917年,美国细菌学家协会指导和撰写了细菌分类学著作《伯杰氏细菌鉴定手册》(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)至今仍是国际上从事研究细菌学工作者必备的工具书。
20世纪40至50年代这一时期在试验手段上只是从数量上增加生理学、生物化学的实验及营养要求等。所以,这一时期的细菌分类只是量上的变化,没有质的飞跃。在这时期中,科学家们也曾试图建立新的分类系统,但由于实验手段的限制,未能实现[1]。
在这同一时期中,随着分子生物学技术的建立和日臻完善,20世纪60年代末Carl Woese和George Fo*根据所有细胞生物中均含有rRNA分子,其大小适中(约1540bp)、碱基组成保守、一级结构和高级结构高度保守、功能保守等特征,确认16S rRNA的变异不受环境影响,只是时间的函数,是度量生物进化、进化谱系分析极佳的“分子尺”。在进行了原核生物16S rRNA、真核生物18S rRNA的寡核苷酸编目检测后,比较各类生物的rRNA特征序列,从序列差异计算出不同生物间的进化距离,绘制出系统发育树(phylogenetic tree)(图1-1)[2]。
2、 本课题的主要研究内容(提纲)和成果形式:
主要内容:本课题主要对分离自北极的蛋白酶产生菌株VV6和VV7进行分类鉴定,探索其系统进化地位。实验内容包括细菌形态特征观察、生理生化特征实验、DNA中G+C mol%测定、以及16S rRNA 基因序列分析。
成果形式:以数学模型和
论文的形式提交成果。
4、拟解决的关键问题:
拟解决的关键问题:对优化过程中若干参数的相互影响与干扰进行细致调节,努力获得全局化考量。
5、研究思路、方法和步骤:
研究思路、方法和步骤:
1、细菌总DNA的提取
2、琼脂糖凝胶电泳
3、感受态细胞的制备
4、感受态细胞效价
5、16S rRNA基因PCP扩增
6、PCR 产物纯化
7、16S rRNA基因核酸内切酶酶切反应
8、聚丙烯酰胺凝胶电泳
9、RFLP图谱分析
10、连接反 ……(未完,全文共5210字,当前仅显示1829字,请阅读下面提示信息。
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